Microbiome LifePipe®
Analyse et management des données de séquençage du microbiome
Microbiome LifePipe® est un logiciel bio-informatique automatisé dédié à l’analyse et au management des données de séquençage du microbiome pour les industries pharmaceutiques, cosmétiques et les laboratoires de recherche et de diagnostic.
Microbiome LifePipe® 16S
Microbiome LifePipe® 16S permet, en se basant sur les données de séquençage d’une partie de la région codant l’ARNr 16S, de déterminer les différentes genres bactériens présents dans un échantillon.
Type de données : short reads
Niveau taxonomique identifié : espèces, recommandé : genres
Microbiome LifePipe® Full 16S
Microbiome LifePipe® Full 16S se base sur les données de séquençage de l’intégralité de la région codant l’ARNr 16S (~1500pb) et améliore ainsi l’assignation taxonomique des bactéries de l’échantillon.
Type de données : long reads
Niveau taxonomique : espèces
Microbiome LifePipe® Shotgun
MicrobiomeLifePipe® Shotgun propose une analyse multi-règnes des données de séquençage ADN de l’ensemble des micro-organismes présents dans un échantillons.
Type de données : short reads ou long reads
Niveau taxonomique : espèces
Fonctionnalités
Abondances absolues et relatives
Alpha et beta diversités
Choix des bases de données
Visualisation dynamique
Par choix du topN, choix du niveau taxonomique
Comparaison d'échantillons
Monitoring des micro-organismes d'intérêts
Export des données et des figures
Interface User Friendly
Découvrez notre plaquette
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